Le département des instruments polyphoniques (hors piano et clavecin) regroupe les disciplines suivantes : accordéon, harpe, guitare, orgue et percussion classique.

Hétérogène de par la nature des instruments qui le composent, le département des instruments polyphoniques se caractérise par une approche polyphonique de la musique (maîtrise de plusieurs voix jouées simultanément, indépendance des mains et parfois aussi des pieds !).

L'enseignement de chacune de ces disciplines permet à chaque élève d'acquérir progressivement des compétences d'interprète, en complète autonomie à partir d'un répertoire pensé pour un instrument soliste ; des réflexes d'accompagnateur lorsque son instrument est appelé à accompagner d'autres musiciens : instrumentistes, chanteurs, ensemble vocal, théâtre musical, danse ; des qualités de musicien d'ensemble pour le répertoire de musique de chambre ou d'orchestre ainsi qu'une pratique de l'improvisation, initiée dès les premières années dans certaines disciplines.